몸은 길고 앞부분이 약간 옆으로 납작한 원통형이다. 입은 작고 윗입술이 두꺼우며, 양 끝 부분이 두꺼워져서 말굽 모양이다. 입가에는 1쌍의 수염이 있다. 옆줄은 완전하며 몸통 옆면 가운데에 직선으로 이어진다. 등은 암갈색, 배는 담황색을 띤다. 몸통 옆면에 주둥이 앞 끝부터 눈을 지나 꼬리지느러미 앞까지 이르는 너비가 넓은 암갈색 줄무늬가 뚜렷하다. 돌고기는 하천 중상류의 물의 속도가 느리고 맑은 물이 흐르는 자갈바닥에 살며 물속에 사는 곤충을 주로 먹는다. 알을 낳는 시기는 4~6월이며, 자갈이 많은 곳이나 돌 밑에 낳는다.